הרצון להציל את העולם מפני הזיהום שמייצרים בני האדם הוא רצון שמשותף לאנשים רבים על פני כל כדור הארץ. כל תחום ותחום בחיים לשלנו – הפרטיים והציבוריים – הוא תחום שניתן לעשות אותו ידידותי יותר לסביבה. גם בתחום של הובלה ימית יש מקום לשיפורים רבים כדי שהוא יתרום פחות לזיהום כדור הארץ. הובלה ימית נקייה יותר, מזהמת פחות וידידותית יותר לסביבה היא אפשרית גם אם היא דורשת השקעה מסוימת שעלולה לייקר במידת מה את העלות של הובלה ימית.
הזיהום שגורמת הובלה ימית נובע מכמה וכמה מרכיבים. מרכיב ראשון הוא הדלק שבו נעשה שימוש עבור הובלה ימית. דלק אוניות הוא דלק כבד ולא מזוקק והשריפה שלו פולטת חומרים מזהמים שונים: מדו תחמוצת הפחמן ועד תרכובות כימיות שונות שהינן רעילות. כיוון שמעצם מהותה הובלה ימית מתרחשת בים, הדלק הזה פוגע ישירות במערכת האקולוגית הימית. גם מי שלא ממש מתעניין בהישרדות של מינים בסכנת הכחדה צריך להיות מוטרד מהזיהום הנגרם על-ידי אוניות: החומרים הרעילים מגיעים אלינו בסופו של דבר דרך הדגים שאנחנו אוכלים ושמגיעים מהים ודרך הגשם שיורד עלינו שגם הוא – דרך מחזור המים – מגיע מהאוקיינוסים ומהימים. הובלה ימית אקולוגית צריכה להתבסס על דלק נקי יותר ומזהם פחות. הובלה ימית אקולוגית אפילו יותר תעשה שימוש במקורות אנרגיה חלופיים כמו שמש ורוח כדי להימנע משימוש בדלקים מזיקים.
הובלה ימית גם גורמת לזיהום האוקיינוס בגלל דליפות של חומרים מהאוניות אל הים והשלכת פסולת מהאוניה לים. כאן הפיתרון פשוט אפילו יותר: יש ליצור תו תקן אקולוגי עבור חברות הובלה ימית. חברות אלה יתחייבו לדאוג לתקינות מלאה של האוניות שבהן הן עושות שימוש – תקינות שתבטיח שאף חומר מזיק לא ידלוף אל הים ויזהם. חברות הובלה ימית אלה גם יתחייבו שהאוניות שלהן יקפידו על טיפול בפסולת באונייה עצמה ויימנעו מהשלכתו אל הים. אם ניתן להבטיח גם מיחזור מקסימאלי, שימוש בחומרים מתכלים וצמצום הייצור של פסולת מכל סוג שהוא – צעדים שכל חברה, ולא רק חברת הובלה ימית, צריכה להתחייב להם – הרי שמדובר בצעדים נוספים אל הובלה ימית אקולוגית יותר שפוגעת בצורה מינימאלית בסביבה. כיוון שהסביבה המיידית שבה פועלת הובלה ימית היא בים הרי שמדובר כאן בתרומה משמעותית ביותר לשמירה על הסביבה הימית, סביבה שנתונה תחת מתקפת זיהום קשה מאד.