הנהלת חשבונות כפולה הינה הנהלת חשבונות מקיפה ומעמיקה אשר במהלכה מתעד רואה החשבון את כל הפעילויות הפיננסיות המתבצעות בעסק ובין היתר: הכנסות, הוצאות, נכסים והתחייבויות. על פי שיטת הנהלת חשבונות כפולה, על כל פעולה אשר נרשמת בספרים יש לרשום פעולה מנגד – חיוב וזיכוי. הנהלת חשבונות כפולה מאפשרת לבעל העסק ולכל המעורבים בו לקבל תמונה מעמיקה ומקיפה על הפעילויות הפיננסיות והעסקיות השונות של העסק ובעת הצורך להוציא דו"חות מפורטים בנושא. ההוצאה יכולה להשתלם ידוע ששירותי הנהלת חשבונות כפולה יהיו בדרך כלל יקרים יותר מאשר שירותי הנהלת חשבונות חד צידית, יחד עם זאת, מכיוון שמדובר בסוג שירות אשר מחייב רק עסקים גדולים יותר, ההוצאות הן בהתאם לרווחים שלהם ובמידה ושירותי הנהלת חשבונות כפולה ניתנים על ידי רואה חשבון מקצועי ומיומן, שירות זה יכול לסייע לאותו עסק להגדיל את רווחיו וללמוד להתנהל בצורה טובה ונכונה יותר. כך שבסופו של דבר ההוצאה הכספית בהחלט יכולה להשתלם. מי מחויב בהנהלת חשבונות כפולה הקריטריונים השונים בעלי ההשפעה על שיטת הנהלת החשבונות, לוקחים בחשבון פרמטרים שונים כמו היקף המחזור השנתי כמות העובדים ופרמטרים רבים נוספים. באופן כללי, עסקים בעלי היקף פעילות הנחשב לקטן יחסית יחויבו אך ורק בשיטת הנהלת חשבונות חד צידית, לעומתם עסקים עם היקף פעילות הנחשב לגדול יחויבו לבצע הנהלת חשבונות כפולה. כל עסק אשר מחזור העסקים שלו עולה על 1,950,000 ₪ בשנה יהיה מחויב להתנהל בשיטת הנהלת חשבונות כפולה. החוק אף מפרט פרטים נרחבים יותר בנושא כגון: איזה ספרים העסק צריך לנהל. כך שבשורה התחתונה הנהלת חשבונות כפולה היא אינה בחירה, אך צריך לדעת להפיק את המיטב ממנה.