בתי מרקחת מקוונים, או בתי מרקחת באינטרנט, הם בתי מרקחת הפועלים באינטרנט. בתי מרקחת רבים כאלה, במובנים מסוימים, דומה מרקחת קהילתיים, ההבדל העיקרי הוא השיטה שבאמצעותה התרופות הן ביקש וקיבל. ללקוחות יש לשקול את זה כדי להיות יותר נוח מאשר לנסוע לבית המרקחת קהילה, באותו אופן כמו הזמנת סחורה באינטרנט ולא הולך לחנות.

בית מרקחת מקוון המורשה לפעול בישראל.
בעוד בתי מרקחת אינטרנט רבים למכור תרופות מרשם רק עם מרשם רופא, חלקם אינם דורשים מרשם מראש בכתב. במדינות מסוימות, זה כי המרשמים אינם נדרשים. כמה לקוחות תרופות מבתי מרקחת הסדר כזה, כדי למנוע את אי הנוחות של ביקור רופא או לקבל תרופות הרופאים שלהם לא היו מוכנים לקבוע. אנשים החיים בארצות הברית ובמדינות אחרות בו תרופות מרשם יקרות מאוד רשאי לפנות מרקחת מקוונים כדי לחסוך כסף. רבים מאתרים אלה מעסיקות רופאים משלהם בתוך הבית כדי לבדוק את הבקשה תרופות לכתוב מרשם בהתאם. כמה אתרי אינטרנט מציעים תרופות ללא מרשם או סקירה הרופא. פרקטיקה זו זכתה לביקורת כפי שעלול להיות מסוכן, בעיקר על ידי אלו המרגישים כי הרופאים יכולים רק אמין להעריך את התוויות, סיכון / יחסי תועלת, ואת התאמתם של תרופות עבור אדם ספציפי. תרופתי בתי מרקחת המציע ללא צורך במרשם רופא ו ביקורת או פיקוח הם הונאה לפעמים ועלול מזויפת, ולא יעיל ואולי אספקת תרופות מסוכנות. 
בארצות הברית, חלה לדחוף להכשיר ייבוא ​​של תרופות מקנדה במספר מדינות באירופה כדי לצמצם עלויות לצרכן. למרות ביבוא של תרופות מרשם בדרך כלל פוגע מינהל המזון והתרופות האמריקאי (FDA) תקנות וחוקים פדרליים, אכיפה ממוקדת בדרך כלל הספקים סמים בינלאומית, ולא לצרכנים.לעתים קרובות האמריקאים לרכוש תרופות זרות בעלות נמוכה על ידי נהיגה מרקחת קנדי ​​או מקסיקני, קניית תרופות שלהן בעת ​​נסיעה לחו"ל לחופשה, או, לקנות בדואר מבתי מרקחת זרים.

בית מרקחת מדי-לינק: מכירת כל המוצרים לבריאות המשפחה - גם באינטרנט.